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怎样写作出高水平的SCI医学论文，是摆在每个医务工作者面前的一个重要难题。为了提高大家的医学论文写作水平，下面以我国惯用的医学科研论文的一般格式为顺序，并结合较常见到的一些问题逐项加以讨论。
一、标题 (title)
标题亦称文题、题目、题名或篇名，是一篇论文的核心内容的高度精华。拟定标题犹如画龙点睛，关系着整个作品的形象，因此通常是在论文全部完成之后经过反复推敲而得。
标题应选用几个最恰当的词加以逻辑组合，使之能全面、确切、具体而又简明地反应出文章的特定内容。
二、作者(author)
论文标题下应有作者的署名及其所在单位名称和地区邮政编码等。此处的作者应是该项科研课题的承担者及其主要合作者，表示对论文的内容负责，当然也是接受褒奖的依据。
论文的署名必须实事求是，列名者必须是真正参加该项研究的人，而非凡沾边者都得挂上一个名字。只参加部分工作或在某一方面给予了支持的人，可由作者在文章的“致谢”部分加以说明。
三、提要与关键词(synopsis and key words)
此项内容的名称目前尚不甚一致，有作“提要”或“内容提要”者，亦有作“摘要”或“概要”者。在西方医学期刊中也存在同样的问题，常分别采用Abstract、Synopsis、Summary等不同的词(参见后述)。
提要是置于正文之前的一小段重要文字，其性质不是文章的结论或总结，而是对正文的一个扼要而连贯的重述，以供读者确定有无必要阅读下面的全文。本段应以精炼明快的笔法，简要写出研究目的和基本方法，重点说明主要发现、重要数据和初步结论等；应该突出研究中新的发现和重要现象，抓住“创新”与“特色”这两个中心加以叙述。提要应尽可能反映出全文的信息量，忌用含糊不清的词语，也不引证前人的见解。
四、引言(Introduction)
引言亦作导言、前言、序言或序言，其意皆同。引言是正文的开端部分，起着引导或破题与承题的作用，能给人以一个概括印象并提供预备性知识，以便更好地阅读和理解全文的内容。
引言不是对提要的重复、扩展或解释，不讨论基本理论问题，一般教科书中已有的内容也不必赘述，更不要将研究的结论先摆出来。
五、方法(methods)
有些人也常将这一部分的段落标题写成研究对象与方法(subjects and methods)、临床资料与方法(clinical data and methods)或材料与方法(materials and methods)等。本段内容主要是体现该项研究的科研构思与实验设计，使人了解具体的研究方法和有关研究对象的各种情况；也是衡量该论文的科学性的一个重要部分。
六、结果(results)
这一部分是研究者的主要劳动成果，是该项工作所获成绩之总汇，但其内容的表现形式却不应该为大量原始记录的堆积和罗列，而应是经过统计学处理并科学地组织起来的一系列重要数据。
在此一段落中所展示的内容和数据，必须按照逻辑顺序递次列出，、不宜忽此忽彼茫然无序，若将缺乏联系的结果并列在一起，往往会使人感到难以理解和领会。
七、讨论(discussion)
讨论是对研究结果进行理论思维和理性认识的部分，可占全篇论文的较大篇幅。本部分的中心任务是将所获得的资料加以系统化和理论化，同时作出科学的解释与评价，并形成自己的见解和观点，为本项研究的结论打下基础。
八、结论(conclusion)
结论可以单独形成一个段落，亦可置于“讨论”之末而不另立段落标题，近年趋于向后一种形式发展。如果长篇文章，而且结论明确、条理分明，仍应设此段落，可以起到鲜明突出并能给人留下深刻印象的作用。
九、小结(summary)
小结是文末的收尾部分，在前些年的论文中往往单列一项。通常有两种写法：一是按照一般文章的格局，对全文的始末作一概括性归纳，以结束全篇；另一是按照科研论文的撰写习惯，将本项研究的目的、方法、结果、结论作一简要概述，以数行文字集中加以表达。后一种笔法基本上相当于内容提要，因而近些年来不少刊物已明确规定，即正文前有内容提要者文末之小结应删减。
十、参考文献(references)
在一篇科研论文的末后，均应按照有关规定正确地列出参考文献。然而，在目前的一些医学论文(包括论文手稿和已刊出的论文)中，参考文献部分存在的问题可谓最多。
归纳起来主要表现在以下四个方面：①对论文中“参考文献”一项的重要意义认识不足；②文献条目的书写质量较差；③对列出文献的重点和数量掌握不好；④文献条目的书写格式不够标准。
