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近日，国家税务总局征管科技司相关负责人作出特别声明:网上发票管理办法的实施与“电子商务征税”无关。
从4月1日起，《网上发票管理办法》正式实施。这被解释为电子商务税收的技术准备。电子商务征税后，税负成本将转嫁给网上购物消费者，从而削弱电子商务的竞争优势。
据税务系统的人说，网上发票只是发票形式的“升级”。纳税人只需登录网上发票申请系统，简化了审批程序，避免了频繁跑到税务机关收取纸质发票的费用。虽然最终的会计查询和对账等。，仍有必要打印出发票信息；但是，打印次数减少了，并且可以节省纸张。
对于税务机关来说，网上发票是对征管系统的进一步完善，可以防止国税流失，也是打击假发票的长效机制，可以方便税务机关查询和统计开票数据。
“网络发票”的高级版本是“电子发票”，即实现发票的电子化和无纸化。新引进的方法表明，将鼓励区域和工业试点项目。
在今年的全国“两会”期间，一些代表指出，中国电子商务网上购物的发票金额中只有30%是未付的，这导致了网上零售和实体零售之间的不公平竞争。他们呼吁加强对网上购物的监管，并依法对网上商店征税。
然而，电子商务不是免税的。京东、淘宝等电子商务平台公司都是注册公司，在税收方面与其他商业企业没有什么不同。在b2b模式下，双方都是注册的商人，也包括在正常的税收系统中。在b2c模式下，那些拥有实体店并进行品牌管理的商家通常也要交税。
目前，c2c平台上的一些卖家存在税收漏洞，比如淘宝上的一些个体户。他们没有在工商部门注册，也没有在税务部门注册。自然，没有办法收税。
根据艾瑞咨询的《2012年中国网购市场报告》，2012年中国b2c市场的营业额为3800亿元，而c2c达到9100亿元。
中国电子商务研究中心主任曹磊指出，c2c去年的销售额接近1万亿元，而且存在很大的税收漏洞。今后，从市场公平竞争的角度来看，电子商务和实体店应该一视同仁。
但是，曹磊指出，现在“国家富了，人民穷了”，几家实力雄厚的国有企业都有很强的盈利能力；实体经济的税收负担相对较重，因此有必要更普遍地减税，保持实体经济的活力。
中国财经学院税务研究室主任张斌指出，c2c模式下有一些销售额相对较高的个人，应该纳入税收征管体系。然而，也有一些小企业零星销售，或其销售额没有达到增值税的门槛，这应该是免税的。
张斌进一步指出，网上发票和电子发票都将使发票制度更加严格，提高税收征管效率。对电子商务征税的难点在于会加剧税收地域征管模式的矛盾。
